[test_mcq_drop_from_protlist] OK

test_results/test_mcq_drop_from_prolist.err

+Le chargement a nécessité le package : methods
+Warning messages:
+1: In mcq.get.protein.abundances(protPep) :
+  Missing data have not been imputed in the input object of class"mcqProtPep" .
+2: In mcq.get.protein.abundances(protPep) :
+  Peptide intensities are not normalized in the object of class"mcqProtPep" .

test_results/test_mcq_drop_from_prolist.out

+[1] ‘0.3.7’
+2017-01-18 14:04:10
+Test Drop Prolist
+Checking validity
+mcqProtPep object is valid
+Checking mcqMetadata validity
+mcqMetadata object is valid
+#####################################
+		test on protlist  
+#####################################
+Checking validity
+mcqProtList object is valid
+Checking validity
+mcqProtList object is valid
+#####################################
+		nb prot of protPep (original protlist) = nb prot to drop (4) + nb prot of final protlist ? 
+#####################################
+[1] TRUE
+Computing protein abundances as the sum of peptide intensities
+Checking validity
+mcq.protquantity object is valid
+#####################################
+		test on qprot  
+#####################################
+#####################################
+		nb prot of qprot (original) = nb prot to drop (4) + nb prot of final qprot ? 
+#####################################
+[1] TRUE
+#####################################
+		nb prot of final qprot = nb protval of final qprot ? 
+#####################################
+[1] TRUE
+#####################################
+		nb samples of final qprot = nb metadata of final qprot ? 
+#####################################
+[1] TRUE
+#####################################
+		test on protPep  
+#####################################
+cleaning metadata
+cleaning metadata samples
+22 peptides dropped
+4 proteins dropped
+12270 peptiz left
+10480 peptides left
+1788 proteins left
+#####################################
+		nb prot of protPep (original) = nb prot to drop (4) + nb prot of final protPep ? 
+#####################################
+[1] TRUE
+#####################################
+		nb peptides of final protPep (slot peptides) = nb peptides of final protPep (slot proteins) ? 
+#####################################
+[1] TRUE